Em 1962 é nomeado arcebispo de Cracóvia e, cinco anos depois, cardeal. Participa do Concílio Vaticano II entre 1962 e 1965, e ganha notoriedade no meio eclesiástico por suas observações sobre filosofia e teologia. Eleito papa em 1978 com o nome de João Paulo II, revela-se contra a Teologia da Libertação e a favor de uma moral sexual restauradora da identidade católica, sob crescente secularização.
Em seus pronunciamentos condena, sistematicamente, o divórcio, o aborto e os métodos de contracepção. Em 1981 é baleado pelo extremista turco Mehemet Ali Agca, na praça de São Pedro, no Vaticano. Visita o Brasil três vezes, em 1980, 1991 e 1997. Na última vez, permanece quatro dias no país e participa do II Encontro com as Famílias, realizado no Rio de Janeiro. A missa campal celebrada por ele no aterro do Flamengo atrai, aproximadamente, 2 milhões de pessoas.